In den FL Optionen schon gecheckt ob dein Keyboard auch als MIDI-Input-Device deklariert ist?!
/edit:
http://img357.imageshack.us/i/mid.jpg/
P.S.: Auch wenn das jetzt wohl nicht der Auslöser sein wird: USB stinkt. Hatte ich auch längere Zeit, aber imho ist der stinknormale MIDI-Anschluss
weitaus zuverlässiger und sorgenfreier.