Also wenn's den Ordner C:\Programme noch gibt, wirst vermutlich auf C:\Dokumente und Einstellungen auch noch zugreifen können, und da sind deine Eigenen Dateien etc. drinnen!
Das sicherst dir dann alles, neu aufsetzen (warum Batterie raus?

) und dann wieder alles einspielen, dann passt das!
Du dürftest beim neu installieren vermutlich eine neue Version draufgespielt haben und kein Update! Somit hast du 2 Betriebssystem auf einer Platte!
Und warum die Programme nicht mehr funktionieren ist auch klar, da die ganzen Registry-Einträge im ersten Betriebssystem gesetzt sind!